RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM49CP0CI26 452 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 UCHL3P15374 230 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 METTL13Q8N6R0 699 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KAT2BQ92831 832 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FAM212AQ96EL1 285 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MST1RQ04912 1400 aa14.95□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PEX19P40855 299 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CUL1Q13616 776 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GRIK5Q16478 980 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SBK1Q52WX2 424 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 10.8
SGMS1-203ENST00000429490 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 A0A1B0GUA9 196 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SP4Q02446 784 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GDAP1Q8TB36 358 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 HVCN1Q96D96 273 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 VEZTQ9HBM0 779 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KRT5P13647 590 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ERVK-9P63128 1117 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NEDD9Q14511 834 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PROM2Q8N271 834 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PSMD1Q99460 953 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ATRNO75882 1429 aa14.94□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC169A6NNP5 214 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FIGNQ5HY92 759 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NEK9Q8TD19 979 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF384Q8TF68 577 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PNMA5Q96PV4 448 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FAM107AO95990 144 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PLCB3Q01970 1234 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ODR4Q5SWX8 454 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RGL1Q9NZL6 768 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TTLL1O95922 423 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SLURP2P0DP57 97 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC174Q6PII3 467 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NSMFQ6X4W1 530 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 AZI2Q9H6S1 392 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.93□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NR3C1P04150 777 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GALCP54803 685 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 USTQ9Y2C2 406 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 GDF11O95390 407 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MYBP10242 640 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PRLRP16471 622 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FGFR4P22455 802 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SLFN13Q68D06 897 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 LRRC15Q8TF66 581 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ANO3Q9BYT9 981 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RASSF10A6NK89 507 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 PDHBP11177 359 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CASP4P49662 377 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KCNMA1Q12791 1236 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 VSIG1Q86XK7 387 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 NAGPAQ9UK23 515 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.92□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 RSPH10BP0C881 870 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 CEP63Q96MT8 703 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.91□□□□□ -0.02
SGMS1-203ENST00000429490 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms