RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTN1P12814 892 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCY2FP51841 1108 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNH2Q12809 1159 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF3Q9NR23 364 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SIPA1L1O43166 1804 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 EGFRP00533 1210 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEFA5A3E0 1075 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MED24O75448 989 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEIP0CG38 1075 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEGQ6S5H5 508 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.48■□□□□ 0.87
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SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN2DO15399 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH4Q9Y623 1939 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 NR2F2P24468 414 aa20.48■□□□□ 0.87
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SH3BP1-202ENST00000417536 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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SH3BP1-202ENST00000417536 POLD4Q9HCU8 107 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CETN3O15182 167 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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SH3BP1-202ENST00000417536 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CSRNP1Q96S65 589 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PAK2Q13177 524 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP58Q5T655 872 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9A1P19634 815 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP1A2P50993 1020 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 NNTQ13423 1086 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIS1O00470 390 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PTK2Q05397 1052 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCLQ13371 301 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PIM2Q9P1W9 311 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 EBAG9O00559 213 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK3O14649 394 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC12A3P55017 1021 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMC6P62333 389 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PACS2Q86VP3 889 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG5Q96R06 1193 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ANO3Q9BYT9 981 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD51CO43502 376 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF4BQ92750 862 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SWAP70Q9UH65 585 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF233A6NK53 670 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL9Q07325 125 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.862e-10■■■■□ 26.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 IQCKQ8N0W5 287 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 USP38Q8NB14 1042 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 GH2P01242 217 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NIM1KQ8IY84 436 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1EQ8WY54 764 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMM50Q9Y512 469 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KA1Q15418 735 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR16Q569H4 304 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 UCHL3P15374 230 aa20.43■□□□□ 0.86
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