RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 NR1H3Q13133 447 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 EYA3Q99504 573 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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HERC3-202ENST00000402738 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 TRPC6Q9Y210 931 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.53□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 KIF28PB7ZC32 967 aa10.52□□□□□ -0.72
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HERC3-202ENST00000402738 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 NSMFQ6X4W1 530 aa10.52□□□□□ -0.72
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HERC3-202ENST00000402738 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 USP40Q9NVE5 1235 aa10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ZFATQ9P243 1243 aa10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
HERC3-202ENST00000402738 ATP10BO94823 1461 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ESYT2A0FGR8 921 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 GCP02774 474 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 NT5C1BQ96P26 610 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ACTN1P12814 892 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 POLD1P28340 1107 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ODR4Q5SWX8 454 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 PI16Q6UXB8 463 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 THAP11Q96EK4 314 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 AGTP01019 485 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.52□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PCGF5Q86SE9 256 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ARL8AQ96BM9 186 aa10.52□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 RFC4P35249 363 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PHKA1P46020 1223 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 SASH3O75995 380 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 BTKQ06187 659 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 AGBL2Q5U5Z8 902 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 SATB2Q9UPW6 733 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 NEK2P51955 445 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 NR1I3Q14994 352 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 TRIM50Q86XT4 487 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 TBCKQ8TEA7 893 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 TRIM51Q9BSJ1 452 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 FAM187AA6NFU0 413 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 PSMD14O00487 310 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 TTI1O43156 1089 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 KDSRQ06136 332 aa10.51□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 OXER1Q8TDS5 423 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CEP19Q96LK0 163 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQC6 194 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PRKAB2O43741 272 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PSMD7P51665 324 aa10.5□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.5□□□□□ -0.73
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