RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMD10O75832 226 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MARK3P27448 753 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MCM2P49736 904 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC42EP1Q00587 391 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 GPNMBQ14956 572 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 INF2Q27J81 1249 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 ODR4Q5SWX8 454 aa9.6□□□□□ -0.87
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MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF576Q9H609 170 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.6□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 EDIL3O43854 480 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MARCH6O60337 910 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 LARGE1O95461 756 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MMP1P03956 469 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 AMHP03971 560 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MBTPS1Q14703 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 LETM2Q2VYF4 491 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT40Q6A162 431 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 Q7L0L9 218 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 WNT8BQ93098 351 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF2CQ99661 725 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.59□□□□□ -0.87
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TDP2O95551 362 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CHRNA1P02708 482 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 KLRC1P26715 233 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TMOD1P28289 359 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 XKR3Q5GH77 459 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.58□□□□□ -0.88
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MT-TS1-201ENST00000387416 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.58□□□□□ -0.88
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MT-TS1-201ENST00000387416 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 RAD9AQ99638 391 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 PPME1Q9Y570 386 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 NCOR1O75376 2440 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 EVPLQ92817 2033 aa9.58□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 WDR81Q562E7 1941 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TLL1O43897 1013 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 JAK2O60674 1132 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 GJB5O95377 273 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 OATP04181 439 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CTSHP09668 335 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 PBX2P40425 430 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMC5P62195 406 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP2R5CQ13362 524 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 OXER1Q8TDS5 423 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TNFRSF25Q93038 417 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 GUCD1Q96NT3 240 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 MAP7D2Q96T17 732 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 INSL6Q9Y581 213 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 TRPV2Q9Y5S1 764 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.57□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.56□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 BTBD18B2RXH4 712 aa9.56□□□□□ -0.88
MT-TS1-201ENST00000387416 CHMP2AO43633 222 aa9.56□□□□□ -0.88
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