RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.81■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 AMNQ9BXJ7 453 aa21.81■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.81■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 GRIN2DO15399 1336 aa21.81■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.81■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 MXD3Q9BW11 206 aa21.81■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L15C9J2P7 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L11C9JVI0 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L18D6R9N7 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L22D6RA61 530 aa21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 USP17L19D6RCP7 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L20D6RJB6 530 aa21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 TLR2O60603 784 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 USP17L24Q0WX57 530 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 SLC12A3P55017 1021 aa21.8■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.8■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 POTECB2RU33 542 aa21.79■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.79■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 HGSNATQ68CP4 663 aa21.79■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 POTEBQ6S5H4 581 aa21.79■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.79■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 ERLIN2O94905 339 aa21.79■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.79■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 KAT2BQ92831 832 aa21.79■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 SREBF1P36956 1147 aa21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 MNAT1P51948 309 aa21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 18.3
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PAN3-201ENST00000380958 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.78■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 A0A087X0T9 212 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 ZNF233A6NK53 670 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 FAM228BP0C875 321 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 IFT20Q8IY31 132 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.77■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 SEC24CP53992 1094 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 TRAF1Q13077 416 aa21.77■■□□□ 1.08
PAN3-201ENST00000380958 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.77■■□□□ 1.08
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PAN3-201ENST00000380958 TRIM37O94972 964 aa21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 ACTN1P12814 892 aa21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 DNM3Q9UQ16 869 aa21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 EPS15P42566 896 aa21.76■■□□□ 1.07
PAN3-201ENST00000380958 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.76■■□□□ 1.07
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