RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ZNF233A6NK53 670 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 H7C0C1 242 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ATP5OP48047 213 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 DPF2Q92785 391 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A5Q01650 507 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 JCADQ9P266 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 FCER1AP12319 257 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 OSTNP61366 133 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CRCPO75575 148 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 HSPA6P17066 643 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 USP11P51784 963 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ECEL1O95672 775 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PPLO60437 1756 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RFX6Q8HWS3 928 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 WDR64B1ANS9 1081 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SEMA3FQ13275 785 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KCNB1Q14721 858 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CD58P19256 250 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CCT6BQ92526 530 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SGK1O00141 431 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CASP8Q14790 479 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 COX16Q9P0S2 106 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SRGAP2O75044 1071 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PALMO75781 387 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 WRNIP1Q96S55 665 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 A6NJR5 290 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MARK3P27448 753 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KRT1P04264 644 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 ZNF543Q08ER8 600 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 NME8Q8N427 588 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KCNB2Q92953 911 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SLC12A2P55011 1212 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 TRIM9Q9C026 710 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RNF146Q9NTX7 359 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 GCLMP48507 274 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 BARGINQ6ZT62 677 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 NEK9Q8TD19 979 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 KRT76Q01546 638 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SPP2Q13103 211 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 USP49Q70CQ1 688 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 NLRP7Q8WX94 980 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 RILPQ96NA2 401 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PQC6 194 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 PDIA5Q14554 519 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.39■■□□□ 1.18
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