RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 GCNT4Q9P109 453 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 LRRC15Q8TF66 581 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SHBGP04278 402 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 PLCG2P16885 1265 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SLC16A2P36021 539 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SATB1Q01826 763 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ZNF449Q6P9G9 518 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CRYMQ14894 314 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 PLCB4Q15147 1175 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CCDC188H7C350 402 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 UBOX5O94941 541 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KLRK1P26718 216 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CYP2J2P51589 502 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 USP11P51784 963 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KCNMA1Q12791 1236 aa25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 GRB10Q13322 594 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RAD54LQ92698 747 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KLHL14Q9P2G3 628 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 POTEB3A0JP26 581 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 POTECB2RU33 542 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 STXBP3O00186 592 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TLR2O60603 784 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 POTEBQ6S5H4 581 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 STK17AQ9UEE5 414 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 CHMP2AO43633 222 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SMIM24O75264 130 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KCNK18Q7Z418 384 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TRIM7Q9C029 511 aa25.97■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ERFP50548 548 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 MXRA7P84157 204 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SETDB1Q15047 1291 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 KCNJ2P63252 427 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 TATDN2Q93075 761 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.95■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 LONRF1Q17RB8 773 aa25.95■■□□□ 1.75
PACS2-201ENST00000325438 ANKRD62A6NC57 917 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 SLC37A4O43826 429 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ORC4O43929 436 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 PLA2G4BP0C869 781 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 KCNJ1P48048 391 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 F8VZ95 297 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 CYTH3O43739 400 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 STAT3P40763 770 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.95■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 GALNT17Q6IS24 598 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 AGAP11Q8TF27 550 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 NAGPAQ9UK23 515 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 GNA14O95837 355 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 UCHL3P15374 230 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 MMP14P50281 582 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 GALCP54803 685 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 DGKHQ86XP1 1220 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 USP17L5A8MUK1 530 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 PJA2O43164 708 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 ZNF131P52739 623 aa25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PACS2-201ENST00000325438 BTG4Q9NY30 223 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms