RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TNMDQ9H2S6 317 aa15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AZI2Q9H6S1 392 aa15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.2■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 E9PMD0 336 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF862O60290 1169 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 STBD1O95210 358 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MYL1P05976 194 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PLA2G4BP0C869 781 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 RARBP10826 455 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PSMC6P62333 389 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AMPD3Q01432 767 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DGKDQ16760 1214 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 XKR3Q5GH77 459 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SV2BQ7L1I2 683 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PAGE5Q96GU1 130 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 KPNA6O60684 536 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 OATP04181 439 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LGALS2P05162 132 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ATP4AP20648 1035 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SLC12A3P55017 1021 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PRKCEQ02156 737 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MCM6Q14566 821 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GLG1Q92896 1179 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FAM167AQ96KS9 214 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 MTRQ99707 1265 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SPC25Q9HBM1 224 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.18■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ADAMTS4O75173 837 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 POSTNQ15063 836 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ANO5Q75V66 913 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BHMT2Q9H2M3 363 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 KCND2Q9NZV8 630 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PPME1Q9Y570 386 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 EVPLQ92817 2033 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 HTTP42858 3142 aa15.17■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 A0A087WWV3 80 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZBTB39O15060 712 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ZEB2O60315 1214 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 AFMP43652 599 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 RARRES1P49788 294 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CAMK4Q16566 473 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 H3BRB1 525 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 HBP1O60381 514 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 F2P00734 622 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 CYP11B2P19099 503 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DPYDQ12882 1025 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PNOCQ13519 176 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 PLCB4Q15147 1175 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 XKR9Q5GH70 373 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 LHX8Q68G74 356 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GPBP1Q86WP2 473 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM50Q86XT4 487 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 SPATA20Q8TB22 786 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 STAMQ92783 540 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM9Q9C026 710 aa15.15■□□□□ 0.02
PRPF18-201ENST00000320054 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms