RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAS1Q92839 578 aa24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 XRCC4Q13426 336 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP95Q96GE4 821 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAAM2Q86T65 1068 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK8P49336 464 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJB7Q6PEY0 223 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNA14O95837 355 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPSAP08865 295 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIEF2Q96C03 454 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC188H7C350 402 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARCH6O60337 910 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR2F2P24468 414 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASP5P51878 434 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMIM23A6NLE4 172 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGGP02679 453 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADCY7P51828 1080 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM37O94972 964 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R7Q15435 360 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACCSLQ4AC99 568 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLCD1Q96CP7 247 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTFR1LQ9H019 292 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEB3A0JP26 581 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLDC2A0PJX2 215 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTECB2RU33 542 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPIP5K2O43314 1243 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MGRN1O60291 552 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHN1P15882 459 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PON1P27169 355 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEBQ6S5H4 581 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPBP1Q86WP2 473 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 BANK1Q8NDB2 785 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOPCQ9HD26 462 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CETN3O15182 167 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMB2P55268 1798 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESYT2A0FGR8 921 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLA2G4BP0C869 781 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSL1Q68DK7 614 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC14L1Q92503 715 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNED1Q8TER0 1413 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLG1Q92896 1179 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FMO2Q99518 471 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.28■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 H2AFZP0C0S5 128 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNQ4P56696 695 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 H2AFVQ71UI9 128 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms