RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.34■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FAM86B1E9PN63 330 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 DGKIO75912 1065 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 SCG2P13521 617 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 SLC26A2P50443 739 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 Q6ZUG5 572 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 CD320Q9NPF0 282 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 PADI3Q9ULW8 664 aa22.33■■□□□ 1.17
CXCL3-201ENST00000296026 TTC3P53804 2025 aa22.33■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 BACH1O14867 736 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 IL9P15248 144 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 NEK9Q8TD19 979 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 BRF1Q92994 677 aa22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ESYT2A0FGR8 921 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 GRM6O15303 877 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 KLRC1P26715 233 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PAK2Q13177 524 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 NME8Q8N427 588 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 KCNB2Q92953 911 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 UIMC1Q96RL1 719 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.31■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS3O15072 1205 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 HBP1O60381 514 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CYP3A4P08684 503 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA4P34932 840 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 KRT76Q01546 638 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 C6orf50Q9HD87 102 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF302Q9NR11 478 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.3■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 COL19A1Q14993 1142 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PKN1Q16512 942 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 MCTP2Q6DN12 878 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CLDND1Q9NY35 253 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 GINS2Q9Y248 185 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.29■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 COL1A2P08123 1366 aa22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 STAG3L1P0CL83 205 aa22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 GJD3Q8N144 294 aa22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PLVAPQ9BX97 442 aa22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 NID2Q14112 1375 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PHKBQ93100 1093 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 TMX1Q9H3N1 280 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.27■■□□□ 1.16
CXCL3-201ENST00000296026 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 NCK2O43639 380 aa22.26■■□□□ 1.15
CXCL3-201ENST00000296026 CSPG5O95196 566 aa22.26■■□□□ 1.15
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