RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 BRD1O95696 1058 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SARSP49591 514 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ERVFC1P60507 584 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 RBM10P98175 930 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SP4Q02446 784 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CES5AQ6NT32 575 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SYCE2Q6PIF2 218 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 THNSL1Q8IYQ7 743 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CDHR1Q96JP9 859 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 KRT23Q9C075 422 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TMEM260Q9NX78 707 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.01□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PLCB3Q01970 1234 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ITIH3Q06033 890 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ODR4Q5SWX8 454 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PCNX4Q63HM2 1172 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 HOMER1Q86YM7 354 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CASP10Q92851 521 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 GLG1Q92896 1179 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CNNM2Q9H8M5 875 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 C1orf112Q9NSG2 853 aa12□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 LAG3P18627 525 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MTHFRP42898 656 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 GATMP50440 423 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PDE1AP54750 535 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 NME8Q8N427 588 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 GPRASP2Q96D09 838 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PIGSQ96S52 555 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.99□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TBKBP1A7MCY6 615 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 INSRRP14616 1297 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MARK3P27448 753 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 IGBP1P78318 339 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CUL5Q93034 780 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TCF25Q9BQ70 676 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 APOL5Q9BWW9 433 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 POMKQ9H5K3 350 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 RGS18Q9NS28 235 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 EVPLQ92817 2033 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.98□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CACNA1BQ00975 2339 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PIK3CDO00329 1044 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 MAFGO15525 162 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 KCNA2P16389 499 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 AOC1P19801 751 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PPM1AP35813 382 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 KRT76Q01546 638 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 KRT17Q04695 432 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 GRM4Q14833 912 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SEC23AQ15436 765 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TMX1Q9H3N1 280 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CWH43Q9H720 699 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 USTQ9Y2C2 406 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 DENND4AQ7Z401 1863 aa11.97□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 DENND3A2RUS2 1198 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ATP9AO75110 1047 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 SDSP20132 328 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms