RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rit2P70425 217 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Top1Q04750 767 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcerg1lQ3B807 590 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmprss11eQ5S248 423 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sp4Q62445 782 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hdac10Q6P3E7 666 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q91Z58 1206 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpc5Q9QX29 975 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Has3O08650 554 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Enc1O35709 589 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MyocO70624 490 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gfpt1P47856 697 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm46P86049 533 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fdxacb1Q3UY23 622 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc18a1Q8R090 521 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CsadQ9DBE0 493 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnh7Q9ER47 1195 aa11.23□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpcr1Q3TNW5 500 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd13cQ3UX43 541 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mapk6Q61532 720 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt31Q61765 416 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Msantd2Q6NZR2 559 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem132dQ76HP3 1097 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btnl9Q8BJE2 536 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SucoQ8C341 1250 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spire2Q8K1S6 718 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp19Q8K4T5 220 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Enox2Q8R0Z2 598 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VillQ91YD6 859 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D5Q8 446 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gad1P48318 593 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nipa1Q8BHK1 323 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8C1R3 189 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trappc12Q8K2L8 797 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Magea4F2Z493 315 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Idh1O88844 414 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P4hbP09103 509 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgfb2P27090 414 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4933427I04RikQ3V053 235 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11437Q5QR91 290 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccpg1Q640L3 753 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt9Q6RHW0 743 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krit1Q6S5J6 736 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Raver2Q7TPD6 673 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Creb3l3Q91XE9 479 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PdhbQ9D051 359 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntn6Q9JMB8 1028 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fem1bQ9Z2G0 627 aa11.22□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam129cD3YZB0 591 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Got1P05201 413 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GcP21614 476 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gjb6P70689 261 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Etv6P97360 485 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrig2Q52KR2 1054 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp13a4Q5XF90 1193 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces1eQ64176 562 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galnt15Q9D2N8 638 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cabp5Q9JLK3 173 aa11.21□□□□□ -0.61
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ripor3A1L3T7 938 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Skint3A7TZF0 458 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc78D3Z5T1 437 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rgs22G3UYX5 1258 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MybP06876 636 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k9Q3U1V8 1077 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Muc3aQ3U5A2 218 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf207Q3V3A7 635 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pacsin1Q61644 441 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IgflQ6B9Z0 140 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bri3bpQ8BXV2 253 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efcab8Q8C9R9 203 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il17cQ8K4C5 194 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppil2Q9D787 521 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tlr2Q9QUN7 784 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cry2Q9R194 592 aa11.21□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pagr1bF6V0H0 108 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map9Q3TRR0 646 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gas8Q60779 478 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpd2Q64521 727 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpt2Q8BGT5 522 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rtp1Q8C8C1 263 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IntS13Q8QZV7 732 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dact1Q8R4A3 778 aa11.2□□□□□ -0.62
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pagr1aQ99L02 253 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms