RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612791.4

MED25-209, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 5 BASIC

Gene MED25, Length 881 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-209	ENST00000612791	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MED25-209	ENST00000612791	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MED25-209	ENST00000612791	IL25	Q9H293	177 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MED25-209	ENST00000612791	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MED25-209	ENST00000612791	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MED25-209	ENST00000612791	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791		B4DLN1	442 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ORC4	O43929	436 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	FGR	P09769	529 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	NOV	P48745	357 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ADAM17	P78536	824 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	UBE3A	Q05086	875 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ALX1	Q15699	326 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.02	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791		A0A0D9SFI3	127 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	FGA	P02671	866 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CHRNA1	P02708	482 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SLC16A2	P36021	539 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.01	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HIP1	O00291	1037 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SP9	P0CG40	484 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TGM1	P22735	817 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SGSM2	O43147	1006 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SEC24B	O95487	1268 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	GHR	P10912	638 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ARHGAP8	P85298	464 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MGAT3	Q09327	533 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	LPIN1	Q14693	890 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	COL20A1	Q9P218	1284 aa		12.99	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791		H3BRB1	525 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ITIH3	Q06033	890 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	STXBP2	Q15833	593 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TTC14	Q96N46	770 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MAF1	Q9H063	256 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	HAND2	P61296	217 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	CASC1	Q6TDU7	716 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MED25-209	ENST00000612791	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms