RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612048.4

P3H3-211, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 3, human

TSL 1 (best)

Gene P3H3, Length 2,129 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P3H3-211	ENST00000612048	EPC1	Q9H2F5	836 aa		18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RPTOR	Q8N122	1335 aa		18.83	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	EPHB6	O15197	1021 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZBED6	P86452	979 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TEX35	Q5T0J7	233 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	GOLGA1	Q92805	767 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	NDUFA10	O95299	355 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	GHRHR	Q02643	423 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.82	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048		A0A1W2PQJ5	194 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MYB	P10242	640 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	HOXD13	P35453	343 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ARHGAP25	P42331	645 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TUBB2A	Q13885	445 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	DCAF15	Q66K64	600 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	WRNIP1	Q96S55	665 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		18.81	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	WNK4	Q96J92	1243 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CDC23	Q9UJX2	597 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SFI1	A8K8P3	1242 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PTPRA	P18433	802 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	USP14	P54578	494 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	BACE1	P56817	501 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		18.8	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	DOCK1	Q14185	1865 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	BCR	P11274	1271 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ADAM9	Q13443	819 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	EPHA7	Q15375	998 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RIT2	Q99578	217 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	VWA5A	O00534	786 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ATG4C	Q96DT6	458 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		18.79	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CHMP4BP1	P59074	171 aa		18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CEP112	Q8N8E3	955 aa		18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		18.78	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	CTAGE9	A4FU28	777 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	ZBED4	O75132	1171 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	SASH3	O75995	380 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	GNA14	O95837	355 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	MUT	P22033	750 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	HERVK_113	P62684	666 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	KCNA1	Q09470	495 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	TKFC	Q3LXA3	575 aa		18.77	■□□□□ 0.6
P3H3-211	ENST00000612048	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		18.77	■□□□□ 0.6

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