RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 POTEMA6NI47 508 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ARVCFO00192 962 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 EML1O00423 815 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF862O60290 1169 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 SORBS3O60504 671 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 MYL3P08590 195 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ADAM17P78536 824 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 SP4Q02446 784 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 RBL2Q08999 1139 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 EPHA7Q15375 998 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 IL17AQ16552 155 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 FERMT2Q96AC1 680 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM167AQ96KS9 214 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 AK8Q96MA6 479 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 RAB34Q9BZG1 259 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 AZI2Q9H6S1 392 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF302Q9NR11 478 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 CLIC4Q9Y696 253 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 STK24Q9Y6E0 443 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-221ENST00000591856 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 CHMP2AO43633 222 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PPP6R2O75170 966 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 STBD1O95210 358 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 CD4P01730 458 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP4AP20648 1035 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 RPA1P27694 616 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 TXKP42681 527 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 STAT5BP51692 787 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PSMC5P62195 406 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PRKCEQ02156 737 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 ITGA7Q13683 1181 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PLCB4Q15147 1175 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 UGCGQ16739 394 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 HYIQ5T013 277 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 C4orf19Q8IY42 314 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 LXNQ9BS40 222 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PPME1Q9Y570 386 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 MYH11P35749 1972 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 NRCAMQ92823 1304 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 BACH1O14867 736 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 MARCH6O60337 910 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 HBP1O60381 514 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 OATP04181 439 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 RTP1P59025 263 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 PSMC6P62333 389 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 XKR3Q5GH77 459 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 ERMNQ8TAM6 284 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 GLG1Q92896 1179 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 UIMC1Q96RL1 719 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 CEP89Q96ST8 783 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-221ENST00000591856 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms