RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 KRT6BP04259 564 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 KIFAP3Q92845 792 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 OMA1Q96E52 524 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NWD1Q149M9 1564 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GAS7O60861 476 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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