RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 RTP2Q5QGT7 225 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NUP43Q8NFH3 380 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ARMC5Q96C12 935 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 JMJD8Q96S16 334 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQY0 241 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SHOXO15266 292 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ARL4AP40617 200 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 NCKAP1LP55160 1127 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CASP7P55210 303 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CHRNA2Q15822 529 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SYT8Q8NBV8 401 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CXorf38Q8TB03 319 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 C9IYK1 514 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP10-2P60368 255 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 RPTNQ6XPR3 784 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 GCC1Q96CN9 775 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 DCTPP1Q9H773 170 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 JAG2Q9Y219 1238 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 PXDNQ92626 1479 aa6.72□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 CPDO75976 1380 aa6.71□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.71□□□□□ -1.33
TRDN-205ENST00000546248 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 KLF4O43474 513 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 HOXB7P09629 217 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 MSL3P1P0C860 447 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 TEFQ10587 303 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 CEP85Q6P2H3 762 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 MEIS3Q99687 375 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 STK31Q9BXU1 1019 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 ST7Q9NRC1 585 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 PRR13Q9NZ81 148 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.71□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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TRDN-205ENST00000546248 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 MVKQ03426 396 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 RAB33AQ14088 237 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 PWWP2AQ96N64 755 aa6.7□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRDN-205ENST00000546248 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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TRDN-205ENST00000546248 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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TRDN-205ENST00000546248 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 FXNQ16595 210 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 GNPTABQ3T906 1256 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 SOGA3Q5TF21 947 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 SP8Q8IXZ3 490 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.69□□□□□ -1.34
TRDN-205ENST00000546248 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.69□□□□□ -1.34
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