RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2C9P11712 490 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CPA1P15085 419 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM2P49736 904 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 STAT5BP51692 787 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 JAK3P52333 1124 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SP4Q02446 784 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RBL2Q08999 1139 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FUT2Q10981 343 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PPFIA1Q13136 1202 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 STK3Q13188 491 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM240Q5SV17 173 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SKAP1Q86WV1 359 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BLIDQ8IZY5 108 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RDM1Q8NG50 284 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT8Q92599 483 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PHKBQ93100 1093 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TIFAQ96CG3 184 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RIT2Q99578 217 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPC6Q9Y210 931 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1GO43497 2377 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIN2DO15399 1336 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEB3A0JP26 581 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR64B1ANS9 1081 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEB2O15479 319 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 HBP1O60381 514 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GAS7O60861 476 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 AMHP03971 560 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ACRP10323 421 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CKBP12277 381 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNA2P16389 499 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB5P18084 799 aa6.34□□□□□ -1.39
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CLSTN3-215ENST00000544584 DNM2P50570 870 aa6.34□□□□□ -1.39
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CLSTN3-215ENST00000544584 AAK1Q2M2I8 961 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR16Q569H4 304 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 POTEBQ6S5H4 581 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RPAINQ86UA6 219 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SERINC5Q86VE9 423 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IL31RAQ8NI17 732 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1EQ8WY54 764 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KAT2BQ92831 832 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
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CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF302Q9NR11 478 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PPME1Q9Y570 386 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SQORQ9Y6N5 450 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TRANK1O15050 2925 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CARNS1A5YM72 827 aa6.33□□□□□ -1.4
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