RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 CCNE2O96020 404 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP3A4P08684 503 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 INSRRP14616 1297 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS6KB1P23443 525 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MARK3P27448 753 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCY7P51828 1080 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTR2P61160 394 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PPFIA1Q13136 1202 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LPIN1Q14693 890 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SEPT8Q92599 483 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 BRF1Q92994 677 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 INSL6Q9Y581 213 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 NCOR1O75376 2440 aa13.5□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ESYT2A0FGR8 921 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 AMHP03971 560 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00271P0C7V0 271 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SCG2P13521 617 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PLCB4Q15147 1175 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ABHD15Q6UXT9 468 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CRIPAKQ8N1N5 446 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 GLG1Q92896 1179 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SIP14410 1827 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ENPP3O14638 875 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP4AP20648 1035 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNQ1P51787 676 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 AP3B2Q13367 1082 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PHKBQ93100 1093 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.48□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFRSF10AO00220 468 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PPFIA3O75145 1194 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 GHRP10912 638 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 STAT5BP51692 787 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 APBB2Q92870 758 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 GLT8D2Q9H1C3 349 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.47□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TTC3P53804 2025 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 UPP2O95045 317 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CIITAP33076 1130 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 IGBP1P78318 339 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 EPC2Q52LR7 807 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LENG9Q96B70 501 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 UIMC1Q96RL1 719 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SDF4Q9BRK5 362 aa13.46□□□□□ -0.25
CLSTN3-211ENST00000541667 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IFNAR1P17181 557 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RUFY3Q7L099 469 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 COG5Q9UP83 839 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SQORQ9Y6N5 450 aa13.45□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms