RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CSADQ9Y600 493 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ZHX2Q9Y6X8 837 aa5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 SOBPA7XYQ1 873 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CXCL11O14625 94 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ATP2A1O14983 1001 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FOXN1O15353 648 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 SLC37A4O43826 429 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 NRDCO43847 1150 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RHOBTB3O94955 611 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 KIF20AO95235 890 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 BCRP11274 1271 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PLCG1P19174 1290 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 VCAM1P19320 739 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 HSD17B4P51659 736 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 SNAP25P60880 206 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FANCCQ00597 558 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 NCAPHQ15003 741 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 NR6A1Q15406 480 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PRR16Q569H4 304 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ISM2Q6H9L7 571 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RAD54LQ92698 747 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 HAS1Q92839 578 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 IRF7Q92985 503 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 EXOC1Q9NV70 894 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 BICDL2A1A5D9 508 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GLTPD2A6NH11 291 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PP2D1A8MPX8 630 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MEIS1O00470 390 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 VWA5AO00534 786 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PSMA7O14818 248 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 OPLAHO14841 1288 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MAFGO15525 162 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 AP5Z1O43299 807 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 AP1G2O75843 785 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 SERPINC1P01008 464 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ALAS1P13196 640 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 BMP6P22004 513 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RPA1P27694 616 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CDC25AP30304 524 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 EPHX2P34913 555 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 UBASH3AP57075 661 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ASIC1P78348 528 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PPATQ06203 517 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PAK1Q13153 545 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GRB10Q13322 594 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CUL4BQ13620 913 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GPR162Q16538 588 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FILIP1LQ4L180 1135 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CEP55Q53EZ4 464 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 UNC13DQ70J99 1090 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ERO1BQ86YB8 467 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MEIOBQ8N635 442 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MB21D1Q8N884 522 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 NEK9Q8TD19 979 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 PNMA5Q96PV4 448 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 RIT2Q99578 217 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 TRIM9Q9C026 710 aa5.94□□□□□ -1.46
CKAP5-211ENST00000532321 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms