RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CDKL5	O76039	1030 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CTSH	P09668	335 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MYOG	P15173	224 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	THPO	P40225	353 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	RABGGTB	P53611	331 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	IGBP1	P78318	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PPFIA1	Q13136	1202 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	NR5A1	Q13285	461 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GRIK4	Q16099	956 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	INF2	Q27J81	1249 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GLG1	Q92896	1179 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	WNT7A	O00755	349 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC37A4	O43826	429 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CXCL10	P02778	98 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	INSRR	P14616	1297 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAJB2	P25686	324 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	RFC2	P35250	354 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	STAT5B	P51692	787 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	USP11	P51784	963 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PFKM	P08237	780 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP3A7	P24462	503 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB103A	P81534	67 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GUCY1B3	Q02153	619 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MGAT3	Q09327	533 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68	2e-6	■■■□□ 15.9
PABPC1-222	ENST00000523555	UGCG	Q16739	394 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555		Q4G0T1	1027 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	BACH1	O14867	736 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CHMP2A	O43633	222 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF862	O60290	1169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	PSMD10	O75832	226 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CHRNA1	P02708	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	KRT40	Q6A162	431 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68	4e-10	■■■□□ 15.5
PABPC1-222	ENST00000523555	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TIFA	Q96CG3	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PABPC1-222	ENST00000523555	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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