RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TEPSINQ96N21 525 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 OPA1O60313 960 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 STPG3Q8N7X2 389 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF839A8K0R7 811 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 PRRG2O14669 202 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 GJA4P35212 333 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 BDH2Q9BUT1 245 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM260Q9NX78 707 aa6.3□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 KCNQ2O43526 872 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 KRT37O76014 449 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 SYN1P17600 705 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 KCNA6P17658 529 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM177Q53S58 311 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 BORAQ6PGQ7 559 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 SLC12A8A0AV02 714 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 B8ZZF3 427 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 M0R2C6 588 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 IGFALSP35858 605 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 PLP2Q04941 152 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 LGI4Q8N135 537 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 CXorf38Q8TB03 319 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 NUDT11Q96G61 164 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPEB4-210ENST00000522344 KCND1Q9NSA2 647 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 INVSQ9Y283 1065 aa6.28□□□□□ -1.4
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF536O15090 1300 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 C9orf118A6NHY6 69 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 B4E1Z4 1266 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 HIP1RO75146 1068 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 NPTXRO95502 500 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 IL18BPO95998 194 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 ASLP04424 464 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 COL6A1P12109 1028 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 PTGS1P23219 599 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 MC4RP32245 332 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF460Q14592 562 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 SEC23AQ15436 765 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 HOMER1Q86YM7 354 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 FANCLQ9NW38 375 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.27□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 H0Y858 1186 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 KNG1P01042 644 aa6.26□□□□□ -1.41
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CPEB4-210ENST00000522344 NFATC3Q12968 1075 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 TCEA2Q15560 299 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 TM4SF20Q53R12 229 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.26□□□□□ -1.41
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CPEB4-210ENST00000522344 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 INCENPQ9NQS7 918 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CPEB4-210ENST00000522344 B4GALT3O60512 393 aa6.25□□□□□ -1.41
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