RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CCDC66A2RUB6 948 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM221BA6H8Z2 402 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 H0Y858 1186 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ACOT7O00154 380 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 B4GALT4O60513 344 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KLHL18O94889 574 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CRTAMO95727 393 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KNG1P01042 644 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PDE6AP16499 860 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KRT15P19012 456 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EPHB4P54760 987 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KRTAP10-2P60368 255 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADAM17P78536 824 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FIGNQ5HY92 759 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CPZQ66K79 652 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLFN13Q68D06 897 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 Q6ZUG5 572 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OSTM1Q86WC4 334 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 REXO1L1PQ8IX06 675 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFNL2Q8IZJ0 200 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 STPG3Q8N7X2 389 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNAJC7Q99615 494 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC39A2Q9NP94 309 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NDOR1Q9UHB4 597 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYRFQ9Y2G1 1151 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FAM90A27PA6NNH2 459 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAN2B1O00754 1011 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IL18BPO95998 194 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AMY2AP04746 511 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 INSRRP14616 1297 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AMY2BP19961 511 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DNM2P50570 870 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 JAM2P57087 298 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF568Q3ZCX4 644 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GGNQ86UU5 652 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GSTCDQ8NEC7 633 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AJUBAQ96IF1 538 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C8orf49Q96NF6 230 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC52A2Q9HAB3 445 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CBLCQ9ULV8 474 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 JAG2Q9Y219 1238 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CUTAO60888 179 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NPTXRO95502 500 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF20P17024 532 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTGS1P23219 599 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POLD1P28340 1107 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CSF2RBP32927 897 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 HERVK_113P62684 666 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 USP10Q14694 798 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WDR72Q3MJ13 1102 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C2orf27AQ580R0 203 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRIM61Q5EBN2 209 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 JMYQ8N9B5 988 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WDR48Q8TAF3 677 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CARD11Q9BXL7 1154 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KATNBL1Q9H079 304 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OSBPL2Q9H1P3 480 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DEF6Q9H4E7 631 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SEC61A2Q9H9S3 476 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SMURF1Q9HCE7 757 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FBXO10Q9UK96 956 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ESYT3A0FGR9 886 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KCNK3O14649 394 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GPR42O15529 346 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RASGRP1O95267 797 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AOAHP28039 575 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms