RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM253P0C7T8 217 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPEP16870 476 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNGA1P29973 690 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 THBS2P35442 1172 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNTBP49356 437 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF11P52732 1056 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXO4P98177 505 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 OCRLQ01968 901 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF174Q15697 407 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR158Q5T848 1215 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP7Q93009 1102 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 C16orf92Q96LL3 132 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTC1Q99614 292 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 YIPF4Q9BSR8 244 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTLC3Q9NUV7 552 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTBD7Q9P203 1132 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF839A8K0R7 811 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 GOLGA6L22H0YM25 854 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXP2O15409 715 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR39O43194 453 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT37O76014 449 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP2C8P10632 490 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC9A1P19634 815 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 AOAHP28039 575 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 MC3RP41968 323 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ID4P47928 161 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHC1P78364 1004 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTRA3P83110 453 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAP1Q01518 475 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC32Q14392 662 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAT4Q14765 748 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHA7Q15375 998 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD276Q5ZPR3 534 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 OGFOD2Q6N063 350 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 DTX3Q8N9I9 347 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASB15Q8WXK1 588 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIGLEC10Q96LC7 697 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOX5Q96PH1 765 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYT3Q9BQG1 590 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 EMC7Q9NPA0 242 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFIBO00712 420 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPIG6BO95866 241 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMEP08473 750 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1QTNF9P0C862 333 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGA1P56199 1179 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL2P60568 153 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PFKPQ01813 784 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAM9Q13443 819 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TERF2Q15554 542 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIPIQ6XZB0 460 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATG14Q6ZNE5 492 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM129CQ86XR2 697 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 NME9Q86XW9 330 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PASD1Q8IV76 773 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTLL6Q8N841 843 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 KYQ8NBH2 561 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATL2Q8NHH9 583 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX11Q96FC9 970 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 GBP4Q96PP9 640 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM209Q96SK2 561 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZMAT4Q9H898 229 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD320Q9NPF0 282 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCM8Q9UJA3 840 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms