RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509206.1

RNF4-211, Transcript of ring finger protein 4, human

TSL 3

Gene RNF4, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF4-211	ENST00000509206	JUND	P17535	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CA8	P35219	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	GGCX	P38435	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MTHFR	P42898	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	STAT2	P52630	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TDG	Q13569	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PTPRN	Q16849	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CASP10	Q92851	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF292	O60281	2723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	GLP2R	O95838	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PROS1	P07225	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	GNAT1	P11488	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	NPR3	P17342	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	DNAJB1	P25685	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	SLC1A4	P43007	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	SNAP25	P60880	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ITIH3	Q06033	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PDE4C	Q08493	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	NR1H3	Q13133	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CAMK1	Q14012	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68	6e-7	■■■□□ 19.2
RNF4-211	ENST00000509206	DUSP6	Q16828	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	KAT2B	Q92831	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	DMD	P11532	3685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	ENPP3	O14638	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	SLC30A4	O14863	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RNF4-211	ENST00000509206	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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