RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ESYT3A0FGR9 886 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 MROH6A6NGR9 719 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 COL6A1P12109 1028 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM260Q9NX78 707 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SCDO00767 359 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FBXO21O94952 628 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ASMTLO95671 621 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 KCNA6P17658 529 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 GJA4P35212 333 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TM4SF20Q53R12 229 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 UBXN11Q5T124 520 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 STPG3Q8N7X2 389 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CXorf38Q8TB03 319 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 BDH2Q9BUT1 245 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 IL18BPO95998 194 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SYN1P17600 705 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SEC23AQ15436 765 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM177Q53S58 311 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 NUDT11Q96G61 164 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 KCND1Q9NSA2 647 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-215ENST00000506510 C9orf118A6NHY6 69 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 B8ZZF3 427 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 OPA1O60313 960 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 MC4RP32245 332 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 IGFALSP35858 605 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF460Q14592 562 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 FAM124AQ86V42 546 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 INVSQ9Y283 1065 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KNG1P01042 644 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 BORAQ6PGQ7 559 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 LGI4Q8N135 537 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 MBD6Q96DN6 1003 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 NCANO14594 1321 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 SLC12A8A0AV02 714 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 M0R2C6 588 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 B4GALT3O60512 393 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL18O94889 574 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 MMEP08473 750 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 SDSP20132 328 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PTGS1P23219 599 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 AOAHP28039 575 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD7Q9P203 1132 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PRRG2O14669 202 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KRT37O76014 449 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 NPTXRO95502 500 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ASLP04424 464 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 CELA3BP08861 270 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 IRF9Q00978 393 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PLP2Q04941 152 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 NFATC3Q12968 1075 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 FANCLQ9NW38 375 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 RASSF10A6NK89 507 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 B4E1Z4 1266 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 H0Y858 1186 aa6.85□□□□□ -1.31
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