RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495893.6

PHC3-215, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHC3, Length 12,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-215ENST00000495893 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PPME1Q9Y570 386 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 KRT39Q6A163 491 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 SV2BQ7L1I2 683 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 BRF1Q92994 677 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 NLRP4Q96MN2 994 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PIGUQ9H490 435 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PGM3O95394 542 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PRKAR2BP31323 418 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PSMC6P62333 389 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PDCLQ13371 301 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 RASGRF1Q13972 1273 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 EPN3Q9H201 632 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 SERPINB8P50452 374 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 MICU3Q86XE3 530 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 NLRP3Q96P20 1036 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 TAF4O00268 1085 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 CCDC22O60826 627 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 IFNA8P32881 189 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 POTEAQ6S8J7 498 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 USP28Q96RU2 1077 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PHC3-215ENST00000495893 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ORC4O43929 436 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 BRD1O95696 1058 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 AP1S2P56377 157 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ATP8B2P98198 1209 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 BFSP1Q12934 665 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 NEK9Q8TD19 979 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 MAML1Q92585 1016 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 SOX13Q9UN79 622 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 CAND2O75155 1236 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 SOX6P35712 828 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 DNM2P50570 870 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 PUDPQ08623 228 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 EPS8Q12929 822 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 FMO2Q99518 471 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 BCS1LQ9Y276 419 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 B4DLN1 442 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 TBC1D4O60343 1298 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 COPB2P35606 906 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ACAD11Q709F0 780 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 PASD1Q8IV76 773 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 TINF2Q9BSI4 451 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 VPS16Q9H269 839 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 C6orf50Q9HD87 102 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 RAB20Q9NX57 234 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 BTBD7Q9P203 1132 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 KRT16P08779 473 aa4.09□□□□□ -1.76
PHC3-215ENST00000495893 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms