RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 BACH1O14867 736 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MSH4O15457 936 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ATG7O95352 703 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PFKMP08237 780 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CTSHP09668 335 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PBX2P40425 430 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 STAT5BP51692 787 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ADAM17P78536 824 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PLCB4Q15147 1175 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 GRIK4Q16099 956 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TCTN1Q2MV58 587 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TRPC6Q9Y210 931 aa13.62□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 EYSQ5T1H1 3165 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 FAM205CA6NFA0 338 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 RSPH10BP0C881 870 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 INSRRP14616 1297 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CYP3A7P24462 503 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SLC5A5Q92911 643 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 POTEB3A0JP26 581 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CHMP2AO43633 222 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 GAS7O60861 476 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 CXCL10P02778 98 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ACTN1P12814 892 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB2P25686 324 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 KRT2P35908 639 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 RABGGTBP53611 331 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 NR5A1Q13285 461 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 LETM2Q2VYF4 491 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 Q4G0T1 1027 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 POTEBQ6S5H4 581 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MBOAT7Q96N66 472 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 PBX4Q9BYU1 374 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ZNF302Q9NR11 478 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SLC37A4O43826 429 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ATP4AP20648 1035 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 KRT76Q01546 638 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 GUCY1B3Q02153 619 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 RABEP1Q15276 862 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 KRT40Q6A162 431 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 TIFAQ96CG3 184 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 GUCD1Q96NT3 240 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 SAMM50Q9Y512 469 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 A0A0C4DFX4 3053 aa13.58□□□□□ -0.23
NISCH-214ENST00000490425 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 WDR64B1ANS9 1081 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 BTBD18B2RXH4 712 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PSMD10O75832 226 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PSAPP07602 524 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MYOGP15173 224 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TRIM29Q14134 588 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 NEK8Q86SG6 692 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TNFRSF25Q93038 417 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 RIT2Q99578 217 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms