RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480038.1

FBXO11-208, Transcript of F-box protein 11, human

TSL 4

Gene FBXO11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO11-208	ENST00000480038	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	C8B	P07358	591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ATRN	O75882	1429 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DGKI	O75912	1065 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CYP2C8	P10632	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	GPR85	P60893	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	RASA3	Q14644	834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	MKL1	Q969V6	931 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SLIT1	O75093	1534 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	BLACE	A4D250	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CELA3B	P08861	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65	5e-6	■■■■□ 21
FBXO11-208	ENST00000480038	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	MAFK	O60675	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	GRK2	P25098	689 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	GRK3	P35626	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	SLURP1	P55000	103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	KY	Q8NBH2	561 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	CDC6	Q99741	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	TET3	O43151	1660 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO11-208	ENST00000480038	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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