RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477942.5

FANCC-208, Transcript of FA complementation group C, human

TSL 3

Gene FANCC, Length 842 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCC-208	ENST00000477942	SEC23A	Q15436	765 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	CYTH3	O43739	400 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	GNAT1	P11488	350 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	NDUFV1	P49821	464 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	COASY	Q13057	564 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	NEDD9	Q14511	834 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	PIGS	Q96S52	555 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FANCC-208	ENST00000477942	NRCAM	Q92823	1304 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ST18	O60284	1047 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GSE1	Q14687	1217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	P2RX5	Q93086	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	FIBP	O43427	364 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	NRIP1	P48552	1158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SP4	Q02446	784 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PKN1	Q16512	942 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	IL25	Q9H293	177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ATP9A	O75110	1047 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	STAM2	O75886	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	CD52	P31358	61 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GATM	P50440	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GRM4	Q14833	912 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GRIK4	Q16099	956 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SUSD6	Q92537	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PRRX2	Q99811	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	KRT23	Q9C075	422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	GFRA3	O60609	400 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	KCNA2	P16389	499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	MARK3	P27448	753 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TROAP	Q12815	778 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FANCC-208	ENST00000477942	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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