RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 YME1L1Q96TA2 773 aa25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 C6orf50Q9HD87 102 aa25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 CHRNA1P02708 482 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 NEFLP07196 543 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 INSRRP14616 1297 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 RPS6KB1P23443 525 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 SREBF1P36956 1147 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 STAT5BP51692 787 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 ERVK-21P61565 698 aa25.08■■□□□ 1.61
RBMS1-211ENST00000477486 NFASCO94856 1347 aa25.08■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MEIS1O00470 390 aa25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 GHRP10912 638 aa25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TOP1MTQ969P6 601 aa25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.07■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 BACH1O14867 736 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PPFIA3O75145 1194 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TFF2Q03403 129 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PHKBQ93100 1093 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PCYT2Q99447 389 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MICAL3Q7RTP6 2002 aa25.06■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 M0QZ92 97 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TNFRSF10AO00220 468 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 LPXNO60711 386 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 GNA11P29992 359 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MCTP2Q6DN12 878 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 RPAINQ86UA6 219 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 UIMC1Q96RL1 719 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.05■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 POTEB3A0JP26 581 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PLCB4Q15147 1175 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 IER5Q5VY09 327 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 POTEBQ6S5H4 581 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 COG5Q9UP83 839 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.04■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 LPIN1Q14693 890 aa25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 HLA-CQ95604 372 aa25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.03■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ESYT2A0FGR8 921 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FAM86B1E9PN63 330 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 PKN1Q16512 942 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 FBXL16Q8N461 479 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 BICD2Q8TD16 824 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.02■■□□□ 1.6
RBMS1-211ENST00000477486 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 ATG7O95352 703 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 CYP3A4P08684 503 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 SLC26A2P50443 739 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 MGAT3Q09327 533 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 RUFY3Q7L099 469 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 IL17RAQ96F46 866 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 SAMD11Q96NU1 681 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.01■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 CCNE2O96020 404 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 KCNQ1P51787 676 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 EPC2Q52LR7 807 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 FBXO47Q5MNV8 452 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 PDXDC2PQ6P474 469 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RBMS1-211ENST00000477486 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms