RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TOMM22Q9NS69 142 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC9A1P19634 815 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX3-2P78367 333 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIN1Q05586 938 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHA7Q15375 998 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 MENTQ9BUN1 341 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ACOT7O00154 380 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 DVL2O14641 736 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TGM5O43548 720 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB11FIP3O75154 756 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA7AO75326 666 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PFKLP17858 780 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CD40P25942 277 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 EVA1CP58658 441 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC23AQ15436 765 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TEPPQ6URK8 271 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 RASSF3Q86WH2 238 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB1Q9Y576 335 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 K7ESF4 209 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LRG1P02750 347 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ASGR2P07307 311 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TERF2Q15554 542 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.6□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FBLN1P23142 703 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 AOAHP28039 575 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 BROXQ5VW32 411 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 LDHDQ86WU2 507 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 C16orf92Q96LL3 132 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 GBP4Q96PP9 640 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 DIRC2Q96SL1 478 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.59□□□□□ -1.19
RABGGTB-205ENST00000462042 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ITKQ08881 620 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MLANAQ16655 118 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CR1LQ2VPA4 569 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CD276Q5ZPR3 534 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTD1Q8N815 330 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB15Q8WXK1 588 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMAT4Q9H898 229 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.58□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKD3O94806 890 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MMEP08473 750 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP2C8P10632 490 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 VASNQ6EMK4 673 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 HIPK4Q8NE63 616 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MZB1Q8WU39 189 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM209Q96SK2 561 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KATNA1O75449 491 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PTGS1P23219 599 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms