RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442003.6

CPEB2-205, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CPEB2, Length 6,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB2-205ENST00000442003 RILPQ96NA2 401 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L15C9J2P7 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L11C9JVI0 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L18D6R9N7 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L22D6RA61 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L19D6RCP7 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L20D6RJB6 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ACTN1P12814 892 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 GBP1P32455 592 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 KCNJ6P48051 423 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L24Q0WX57 530 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 RAPH1Q70E73 1250 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 GAP43P17677 238 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ZNF302Q9NR11 478 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 F5H423 210 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ARHGAP6O43182 974 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 DPH5Q9H2P9 285 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 PLA2G4BP0C869 781 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 ATP2A3Q93084 1043 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 FBXO40Q9UH90 709 aa16.08■□□□□ 0.17
CPEB2-205ENST00000442003 SNX1Q13596 522 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 SP8Q8IXZ3 490 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 KRIT1O00522 736 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 GPT2Q8TD30 523 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 WDR64B1ANS9 1081 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 TCP11Q8WWU5 503 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 PARVGQ9HBI0 331 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MTMR3Q13615 1198 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 HDAC11Q96DB2 347 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MAP7Q14244 749 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 LCA5Q86VQ0 697 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 VSIG1Q86XK7 387 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 OPHN1O60890 802 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CEP95Q96GE4 821 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CUEDC2Q9H467 287 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ARHGAP4P98171 946 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 RAB17Q9H0T7 212 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 PSMD14O00487 310 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 TMEM206Q9H813 350 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 SLC9A5Q14940 896 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CDR2Q01850 454 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 PAK2Q13177 524 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 KCTD6Q8NC69 237 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 HSPH1Q92598 858 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 AIFM3Q96NN9 605 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 TMEM260Q9NX78 707 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 KIF3CO14782 793 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 TRAPPC10P48553 1259 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MBD5Q9P267 1494 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ZNF233A6NK53 670 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 H7C1W4 665 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ARMCX2Q7L311 632 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 MED7O43513 233 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 P3H4Q92791 437 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CALN1Q9BXU9 219 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB2-205ENST00000442003 CPB1P15086 417 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms