RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 PHKBQ93100 1093 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.4■■□□□ 1.02
CCDC78-204ENST00000439619 CPLX1O14810 134 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 BACH1O14867 736 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CYP3A4P08684 503 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 INSRRP14616 1297 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 IFNAR1P17181 557 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TCTN1Q2MV58 587 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 IER5Q5VY09 327 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 LCHNA4D1U4 455 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 RFXAPO00287 272 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 EVCP57679 992 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 AAK1Q2M2I8 961 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 YME1L1Q96TA2 773 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.38■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 POTEB3A0JP26 581 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PKN1Q16512 942 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 POTEBQ6S5H4 581 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.37■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 LINC01553A4QN01 128 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 FAM86B1E9PN63 330 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ARHGEF15O94989 841 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ATG7O95352 703 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CHRNA1P02708 482 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 GHRP10912 638 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ERVK-21P61565 698 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 GRB10Q13322 594 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PLCB4Q15147 1175 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TOP1MTQ969P6 601 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 SAMD11Q96NU1 681 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ASB2Q96Q27 587 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PCYT2Q99447 389 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 GBF1Q92538 1859 aa21.36■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 UPP2O95045 317 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 NLRP5P59047 1200 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 NTRK3Q16288 839 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 NME8Q8N427 588 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF302Q9NR11 478 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.35■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 EYSQ5T1H1 3165 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 EPOPA6NHQ4 379 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 HBP1O60381 514 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 KRT76Q01546 638 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PRR16Q569H4 304 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 COG5Q9UP83 839 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 SQORQ9Y6N5 450 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 PPFIA3O75145 1194 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 DEXIO95424 95 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 CCNE2O96020 404 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 MGAT3Q09327 533 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC78-204ENST00000439619 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms