RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 NFASCO94856 1347 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 INSL6Q9Y581 213 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 COL4A6Q14031 1691 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 MEIS1O00470 390 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 SCG2P13521 617 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 ACTR2P61160 394 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 FGD1P98174 961 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TFF2Q03403 129 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 PKN1Q16512 942 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 TOP1MTQ969P6 601 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-B-250ENST00000434333 RPS6KB1P23443 525 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 APBB2Q92870 758 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ESYT2A0FGR8 921 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 FAM86B1E9PN63 330 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ATG7O95352 703 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 GHRP10912 638 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 INSRRP14616 1297 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 NTRK3Q16288 839 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 SDF4Q9BRK5 362 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 CCNE2O96020 404 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 IGBP1P78318 339 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 LPIN1Q14693 890 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 PLCB4Q15147 1175 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.93■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 CYP3A4P08684 503 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 BMP1P13497 986 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 PHKBQ93100 1093 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 AZI2Q9H6S1 392 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.92■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 TNFRSF10AO00220 468 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 UPP2O95045 317 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 REC8O95072 547 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 STAT5BP51692 787 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 KCNQ1P51787 676 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 EVCP57679 992 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 RSPH3Q86UC2 560 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.91■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF76P36508 570 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 YME1L1Q96TA2 773 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 COG5Q9UP83 839 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 TRPC6Q9Y210 931 aa22.9■■□□□ 1.26
HLA-B-250ENST00000434333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 PPFIA3O75145 1194 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 PSMA5P28066 241 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 C6orf50Q9HD87 102 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.89■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 POTEB3A0JP26 581 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 IFNAR1P17181 557 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 AAK1Q2M2I8 961 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 EPC2Q52LR7 807 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 POTEBQ6S5H4 581 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HLA-B-250ENST00000434333 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms