RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 CA3P07451 260 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 CTSHP09668 335 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 NLRP5P59047 1200 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 EFCAB14O75071 495 aa25.17■■□□□ 1.62
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SEMA3B-205ENST00000434030 CCNE2O96020 404 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 STAT5BP51692 787 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 FAM26DQ5JW98 314 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 RPAINQ86UA6 219 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 UIMC1Q96RL1 719 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 EDIL3O43854 480 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 INSRRP14616 1297 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 CIITAP33076 1130 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 SCRN1Q12765 414 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.15■■□□□ 1.62
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SEMA3B-205ENST00000434030 TLL1O43897 1013 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 IGBP1P78318 339 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 ADGRE1Q14246 886 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PLCB4Q15147 1175 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 ARHGEF15O94989 841 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 CHRNA1P02708 482 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PRR16Q569H4 304 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 SEPT8Q92599 483 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 IL17RAQ96F46 866 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 AIFM3Q96NN9 605 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 ZBED2Q9BTP6 218 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 TRPC6Q9Y210 931 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA3B-205ENST00000434030 GJB5O95377 273 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 USP11P51784 963 aa25.13■■□□□ 1.61
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SEMA3B-205ENST00000434030 LENG9Q96B70 501 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 POTEB3A0JP26 581 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 M0R2N6 131 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 PFKFB2O60825 505 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 SEC24BO95487 1268 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC26A2P50443 739 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 MGAT3Q09327 533 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 POTEBQ6S5H4 581 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 RSPH3Q86UC2 560 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 CERS4Q9HA82 394 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 LCHNA4D1U4 455 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 BACH1O14867 736 aa25.11■■□□□ 1.61
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SEMA3B-205ENST00000434030 IGFBP4P22692 258 aa25.11■■□□□ 1.61
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SEMA3B-205ENST00000434030 ANKRD1Q15327 319 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 NPY5RQ15761 445 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 BLIDQ8IZY5 108 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 USP38Q8NB14 1042 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 TBCKQ8TEA7 893 aa25.11■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.11■■□□□ 1.61
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SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF302Q9NR11 478 aa25.11■■□□□ 1.61
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SEMA3B-205ENST00000434030 GALNT17Q6IS24 598 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.1■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 RFXAPO00287 272 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 HBP1O60381 514 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 AMHP03971 560 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 ATP4AP20648 1035 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA3B-205ENST00000434030 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.09■■□□□ 1.61
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