RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBNO60934 754 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CXCL10P02778 98 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP11P51784 963 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RABGGTBP53611 331 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBCKQ8TEA7 893 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYLIPQ8WY64 445 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VWCEQ96DN2 955 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UIMC1Q96RL1 719 aa18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS3O15072 1205 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CIITAP33076 1130 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT76Q01546 638 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HERC6Q8IVU3 1022 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEPT8Q92599 483 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AIFM3Q96NN9 605 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF302Q9NR11 478 aa18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POTEB3A0JP26 581 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 M0QZ92 97 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SEC24BO95487 1268 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSAPP07602 524 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INSRRP14616 1297 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAM17P78536 824 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POTEBQ6S5H4 581 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL17RAQ96F46 866 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCYT2Q99447 389 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.39■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TLL1O43897 1013 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAS7O60861 476 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATG7O95352 703 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCNE2O96020 404 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMHP03971 560 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM29Q14134 588 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPNMBQ14956 572 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIN2CQ14957 1233 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLCB4Q15147 1175 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NECAB1Q8N987 351 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GTF3C6Q969F1 213 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.38■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KAT6AQ92794 2004 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR64B1ANS9 1081 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HBP1O60381 514 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBTPS1Q14703 1052 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ME3Q16798 604 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IER5Q5VY09 327 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APBB2Q92870 758 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CA3P07451 260 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYOGP15173 224 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SZT2Q5T011 3432 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPAINQ86UA6 219 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RIT2Q99578 217 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.36■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL1A2P08123 1366 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MSH4O15457 936 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHMP2AO43633 222 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARCH6O60337 910 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SFNP31947 248 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JAK3P52333 1124 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DEFB103AP81534 67 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INF2Q27J81 1249 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LETM2Q2VYF4 491 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q4G0T1 1027 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM26DQ5JW98 314 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms