RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 RREB1Q92766 1687 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GAS7O60861 476 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 PALMO75781 387 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ABCB4P21439 1286 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 MEA1Q16626 185 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CENPHQ9H3R5 247 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GIT2Q14161 759 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 NYAP2Q9P242 653 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 TISP43B9A030 160 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 TLR2O60603 784 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 KLRC1P26715 233 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ASIC2Q16515 512 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 RETREG2Q8NC44 543 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 DCAF4Q8WV16 495 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 LRRN2O75325 713 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 AKAP3O75969 853 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ARP10275 920 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ALAS1P13196 640 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GUCY2FP51841 1108 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 BAP1Q92560 729 aa21.61■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GFPT2O94808 682 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CAPN2P17655 700 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 NAA35Q5VZE5 725 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 PAFAH1B1P43034 410 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 USP14P54578 494 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SH2D4AQ9H788 454 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 L1RE1Q9UN81 338 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 LAMB1P07942 1786 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 FECHP22830 423 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 NOX5Q96PH1 765 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 WDR18Q9BV38 432 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 MYH10P35580 1976 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 NOL4O94818 638 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 SLC12A3P55017 1021 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM58Q8NG06 486 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 FAM84AQ96KN4 292 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.59■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 OPLAHO14841 1288 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R2P41236 205 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 USP11P51784 963 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 AKT1S1Q96B36 256 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TTLL3-210ENST00000427220 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 POLR2MP0CAP2 368 aa21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ODR4Q5SWX8 454 aa21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NR3C1P04150 777 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NSMFQ6X4W1 530 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SNX12Q9UMY4 172 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 POTEB2H3BUK9 544 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PTK2Q05397 1052 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PSMD2Q13200 908 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GCNT4Q9P109 453 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KCNK3O14649 394 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NOVP48745 357 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TRADDQ15628 312 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CNKSR1Q969H4 720 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.57■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TAF3Q5VWG9 929 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KCTD16Q68DU8 428 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms