RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 STPG3Q8N7X2 389 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 DTX3Q8N9I9 347 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NINJ1Q92982 152 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NUDT11Q96G61 164 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM209Q96SK2 561 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SLC52A2Q9HAB3 445 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZFP69BQ9UJL9 534 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PLAAQ9Y263 795 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC66A2RUB6 948 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 K7ESM1 405 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ARVCFO00192 962 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MAN2B1O00754 1011 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 COL6A1P12109 1028 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CNGA1P29973 690 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PFKPQ01813 784 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MBD6Q96DN6 1003 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MFSD3Q96ES6 412 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 COQ6Q9Y2Z9 468 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF536O15090 1300 aa3.46□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF839A8K0R7 811 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJC6O75061 913 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 RFPL3O75679 317 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO21O94952 628 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 IL18BPO95998 194 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 IGFALSP35858 605 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FLT3P36888 993 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NEK4P51957 841 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ST5P78524 1137 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NFKB2Q00653 900 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SEC23AQ15436 765 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 TM4SF20Q53R12 229 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ERICH6BQ5W0A0 696 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 BTBD8Q5XKL5 378 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CPZQ66K79 652 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FGD2Q7Z6J4 655 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LGI4Q8N135 537 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FBXW5Q969U6 566 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SCLYQ96I15 445 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN18Q99952 460 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SPC25Q9HBM1 224 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SMURF1Q9HCE7 757 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 DLL4Q9NR61 685 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PDE8AO60658 829 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 KLHL18O94889 574 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PLATP00750 562 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ITGB3P05106 788 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MC4RP32245 332 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 EPHA5P54756 1037 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 EFEMP1Q12805 493 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF460Q14592 562 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GPR19Q15760 415 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.45□□□□□ -1.86
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