RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426827.5

TTLL3-208, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 756 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-208	ENST00000426827	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	KRT23	Q9C075	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	UBE3A	Q05086	875 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	SDS	P20132	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	AVPR2	P30518	371 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	NRIP1	P48552	1158 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	GRM4	Q14833	912 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-208	ENST00000426827	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	CYTH3	O43739	400 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	KCNC3	Q14003	757 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	GRIK4	Q16099	956 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	PIGS	Q96S52	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	KCNA2	P16389	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	DUSP6	Q16828	381 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	FSCN2	O14926	492 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	SCG2	P13521	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	CD52	P31358	61 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	NBL1	P41271	181 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	IER5	Q5VY09	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TLE6	Q9H808	572 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	HIP1	O00291	1037 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	CSPG5	O95196	566 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	TROAP	Q12815	778 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-208	ENST00000426827	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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