RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409282.1

LRRTM4-203, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,451 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-203ENST00000409282 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HSPA6P17066 643 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HOXC13P31276 330 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 AP2B1P63010 937 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ATP8B2P98198 1209 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 APBA1Q02410 837 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 POU5F1BQ06416 359 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GGT6Q6P531 493 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 BRINP3Q76B58 766 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 STARD8Q92502 1023 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 KIFC2Q96AC6 838 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 IQCDQ96DY2 449 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 VPS50Q96JG6 964 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 EHD4Q9H223 541 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 NOTOA8MTQ0 251 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GNA14O95837 355 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 COL6A1P12109 1028 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CTRB1P17538 263 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 M6PRP20645 277 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ANXA13P27216 316 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 LTKP29376 864 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 PPP2R1AP30153 589 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HMOX2P30519 316 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CHKAP35790 457 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 RFC5P40937 340 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 UBASH3AP57075 661 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 TBX4P57082 545 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 NLRP6P59044 892 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 KRT83P78385 493 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ATP11AP98196 1134 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 MAP3K12Q12852 859 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 NFE2L1Q14494 772 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 DSTYKQ6XUX3 929 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SLC51BQ86UW2 128 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 USP38Q8NB14 1042 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CCT6BQ92526 530 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 RUBCNQ92622 972 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 PEX13Q92968 403 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 DHX58Q96C10 678 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 OLFM3Q96PB7 478 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HAUS8Q9BT25 410 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CEP44Q9C0F1 390 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 INTUQ9ULD6 942 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CFL2Q9Y281 166 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.05□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 C5orf60A6NFR6 353 aa5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 HIP1O00291 1037 aa5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CDK2AP1O14519 115 aa5.04□□□□□ -1.6
LRRTM4-203ENST00000409282 CPLX1O14810 134 aa5.04□□□□□ -1.6
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