RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 UPP2O95045 317 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
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OPN3-201ENST00000366554 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.72■■□□□ 1.39
OPN3-201ENST00000366554 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.72■■□□□ 1.39
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OPN3-201ENST00000366554 MYH1P12882 1939 aa23.72■■□□□ 1.39
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OPN3-201ENST00000366554 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 DOCK2Q92608 1830 aa23.68■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 FGFR2P21802 821 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 TXNRD1Q16881 649 aa23.67■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 AMPD3Q01432 767 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.67■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.67■■□□□ 1.38
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OPN3-201ENST00000366554 AGTP01019 485 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 IFNAR2P48551 515 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 NEK9Q8TD19 979 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 AK8Q96MA6 479 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.66■■□□□ 1.38
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