RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362827.1

RNU6-446P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 446, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-446P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-446P-201ENST00000362827 LZTR1Q8N653 840 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ABTB2Q8N961 1025 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PGBD4Q96DM1 585 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMEM87BQ96K49 555 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ASPNQ9BXN1 380 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 VPS16Q9H269 839 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 EHMT1Q9H9B1 1298 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MSL2Q9HCI7 577 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SNRKQ9NRH2 765 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC17A6Q9P2U8 582 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SNED1Q8TER0 1413 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARID3CA6NKF2 412 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 LACTBL1A8MY62 500 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SOX11P35716 441 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 LIG3P49916 1009 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 CR1LQ2VPA4 569 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 NLGN2Q8NFZ4 835 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 EDEM1Q92611 657 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PLPPR2Q96GM1 343 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZPBPQ9BS86 351 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 KATNBL1Q9H079 304 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TJP2Q9UDY2 1190 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MEIS1O00470 390 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SOCS2O14508 198 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 WNT9AO14904 365 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC28A2O43868 658 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 FBXO21O94952 628 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 WT1P19544 449 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 WEE1P30291 646 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 L1CAMP32004 1257 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MPLP40238 635 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 HLCSP50747 726 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 IRF9Q00978 393 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNC3Q14003 757 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 BARGINQ6ZT62 677 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMC3Q7Z5M5 1100 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 NEK8Q86SG6 692 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 FAM126BQ8IXS8 530 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 GPR135Q8IZ08 494 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PHACTR4Q8IZ21 702 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC44A3Q8N4M1 653 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MYEOVQ96EZ4 313 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMEM79Q9BSE2 394 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 AP5M1Q9H0R1 490 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRM3Q9NNZ6 103 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 IL17RBQ9NRM6 502 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 STIM2Q9P246 746 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SORCS3Q9UPU3 1222 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 C17orf51A8MQB3 221 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 TNFRSF10BO14763 440 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARHGAP6O43182 974 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRAMEF1O95521 474 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PGRP06401 933 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 GSTM1P09488 218 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 DNAH10OSP0CZ25 163 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 BLOC1S1P78537 153 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PIK3R6Q5UE93 754 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ATCAYQ86WG3 371 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARHGEF19Q8IW93 802 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SEMA5BQ9P283 1151 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 RWDD3Q9Y3V2 267 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 NFS1Q9Y697 457 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 HIVEP2P31629 2446 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 USP17L3A6NCW0 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 USP17L4A6NCW7 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 MGST3O14880 152 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 VAV1P15498 845 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 EPHB2P29323 1055 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 PHF19Q5T6S3 580 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 WWC2Q6AWC2 1192 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 USP17L2Q6R6M4 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 CYP2R1Q6VVX0 501 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-446P-201ENST00000362827 USP17L1Q7RTZ2 530 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms