RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340042.1

GLI4-201, Transcript of GLI family zinc finger 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GLI4, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4-201ENST00000340042 UIMC1Q96RL1 719 aa24.38■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 CCNE2O96020 404 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 CIITAP33076 1130 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TRPC6Q9Y210 931 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 STK36Q9NRP7 1315 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 EYSQ5T1H1 3165 aa24.37■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 STAT5BP51692 787 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 BLIDQ8IZY5 108 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.36■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 BACH1O14867 736 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 ATG7O95352 703 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 MYOGP15173 224 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 NEK4P51957 841 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 IGBP1P78318 339 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TCTN1Q2MV58 587 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 GALNT17Q6IS24 598 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TBCKQ8TEA7 893 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 GBF1Q92538 1859 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 INSRRP14616 1297 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 USP11P51784 963 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 IKBKEQ14164 716 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 PLCB4Q15147 1175 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 ABHD15Q6UXT9 468 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 LENG9Q96B70 501 aa24.35■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 EFCAB14O75071 495 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 XBP1P17861 261 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 SLC26A2P50443 739 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 NPY5RQ15761 445 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 ME3Q16798 604 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 RSPH3Q86UC2 560 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 NECAB1Q8N987 351 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.34■■□□□ 1.49
GLI4-201ENST00000340042 POTEB3A0JP26 581 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 M0R2N6 131 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 DTNBO60941 627 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 LARGE1O95461 756 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 CTDNEP1O95476 244 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 CA3P07451 260 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 DEFB103AP81534 67 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 KRT76Q01546 638 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 POTEBQ6S5H4 581 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 RPAINQ86UA6 219 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 GTF3C6Q969F1 213 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 ZNF302Q9NR11 478 aa24.33■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 KAT6AQ92794 2004 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 KIF28PB7ZC32 967 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 EDIL3O43854 480 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 C8orf34Q49A92 452 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 FAM26DQ5JW98 314 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 WASF1Q92558 559 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 SEPT8Q92599 483 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 MSH4O15457 936 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.481e-6■■■■□ 20.4
GLI4-201ENST00000340042 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.31■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 TLL1O43897 1013 aa24.3■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 TDP2O95551 362 aa24.3■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GLI4-201ENST00000340042 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms