RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 SEC23AQ15436 765 aa22.41■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 TNFRSF25Q93038 417 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 A0A1B0GVG6 124 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 EMC10Q5UCC4 262 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.41■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 VSIG1Q86XK7 387 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 NEK9Q8TD19 979 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 IFT74Q96LB3 600 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.4■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 TBK1Q9UHD2 729 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.4■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 RARAP10276 462 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 USP4Q13107 963 aa22.4■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 SV2BQ7L1I2 683 aa22.4■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 RAB27AP51159 221 aa22.39■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 SLC18A3Q16572 532 aa22.39■■□□□ 1.18
CMTM4-201ENST00000330687 FIGNQ5HY92 759 aa22.39■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 TRIM4Q9C037 500 aa22.39■■□□□ 1.18
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CMTM4-201ENST00000330687 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.39■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM237Q96Q45 408 aa22.39■■□□□ 1.17
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CMTM4-201ENST00000330687 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.37■■□□□ 1.17
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CMTM4-201ENST00000330687 MUM1Q2TAK8 710 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 STX8Q9UNK0 236 aa22.37■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 RFC5P40937 340 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 ICA1Q05084 483 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.36■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CMTM4-201ENST00000330687 DR1Q01658 176 aa22.36■■□□□ 1.17
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