RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	GUP2	Q08929	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TOP3	P13099	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YSP3	P25036	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YUR1	P26725	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FAT1	P38225	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AIM46	P38885	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MET28	P40573	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	OPT1	P40897	799 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NPY1	P53164	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HHO1	P53551	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DYN2	Q02647	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PEX10	Q05568	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRX4	Q12467	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GAL10	P04397	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ATR1	P13090	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	POF1	P25576	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARE1	P25628	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SRO77	P38163	1010 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERV15	P38312	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FET3	P38993	636 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AKR1	P39010	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	BOL3	P39724	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PRM10	P42946	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GTT2	Q12390	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PET20	Q99373	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARG8	P18544	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SEC59	P20048	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CCA1	P21269	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YKU70	P32807	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YBR062C	P38239	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YHR045W	P38775	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DUN1	P39009	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PLB1	P39105	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SEO1	P39709	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GIP2	P40036	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MAM33	P40513	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	THI6	P41835	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YJR149W	P47177	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MTO1	P53070	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR122W	P53272	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SCS7	Q03529	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HIM1	Q06674	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RTT109	Q07794	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SRL2	Q12020	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PTC5	Q12511	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ERG3	P32353	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PTM1	P32857	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPT7	P32939	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRPL4	P36517	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPK3	P38070	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ECM13	P38195	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GOS1	P38736	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TAT2	P38967	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	BDH1	P39714	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PSF2	P40359	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EFM4	P40516	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HXT9	P40885	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GUF1	P46943	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YJL132W	P47014	750 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SOL1	P50278	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HCH1	P53834	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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