RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ECM1	Q16610	540 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.29	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MED24	O75448	989 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX58	Q96C10	678 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADCY6	O43306	1168 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADCY3	O60266	1144 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMPD1	P17405	629 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLCG1	P19174	1290 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTR2	P61160	394 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM32	Q13049	653 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPA1	P27694	616 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRB10	Q13322	594 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHA7	Q15375	998 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	E2F4	Q16254	413 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CALML4	Q96GE6	196 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.28	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLITRK3	O94933	977 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFN	P31947	248 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	JAK3	P52333	1124 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A087WWV3	80 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAT6	P42226	847 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAMK4	Q16566	473 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPH2	Q8IWU9	490 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HYI	Q5T013	277 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNK18	Q7Z418	384 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LXN	Q9BS40	222 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXN1	O15353	648 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GH1	P01241	217 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLFN14	P0C7P3	912 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYBA	P13498	195 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.26	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms