RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 F8W031 263 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ERLIN1O75477 346 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFA10O95299 355 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CTHP32929 405 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SHMT1P34896 483 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CRKP46108 304 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-24P63145 666 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBED6P86452 979 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK17Q00537 523 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DMTNQ08495 405 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 BRD3Q15059 726 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRF4Q8IZF3 695 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PLIN2Q99541 437 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GBP3Q9H0R5 595 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CPVLQ9H3G5 476 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KANSL2Q9H9L4 492 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM260Q9NX78 707 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 B4DLN1 442 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT86O43790 486 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD21O60216 631 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM37O94972 964 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM3P25205 808 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GJA5P36382 358 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 VEGFBP49765 207 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2B2Q01814 1243 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GRB10Q13322 594 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MEA1Q16626 185 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MAN2A1Q16706 1144 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCEQ6IPM2 695 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 STYK1Q6J9G0 422 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1328Q86T90 577 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC51AQ86UW1 340 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SLFN12Q8IYM2 578 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CERS5Q8N5B7 392 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ERMNQ8TAM6 284 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF507Q8TCN5 953 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MTMR8Q96EF0 704 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NYAP2Q9P242 653 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC26A0AVF1 554 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CTAGE15A4D2H0 777 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC151A5D8V7 595 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMD14O00487 310 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 COBLO75128 1261 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TDP2O95551 362 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GNA14O95837 355 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CTAGE8P0CG41 777 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC1A4P43007 532 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 USP11P51784 963 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF6P56537 245 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 GPS2Q13227 327 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 NNTQ13423 1086 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SPA17Q15506 151 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 QPCTQ16769 361 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPPQ6IPU0 288 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CTAGE6Q86UF2 777 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CTAGE4Q8IX94 777 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC65Q8IXS2 484 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35F6Q8N357 371 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 COA7Q96BR5 231 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 IDI2Q9BXS1 227 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-222ENST00000592408 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms