RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP6O43182 974 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CNGA1P29973 690 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGSQ96S52 555 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD4Q9NVX7 518 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.45■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.45■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 STX10O60499 249 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CD44P16070 742 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 GDF15Q99988 308 aa28.44■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF18AQ8NI77 898 aa28.43■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 PAK1Q13153 545 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.42■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPC1 479 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 SEPT4O43236 478 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A4O43511 780 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PGK2P07205 417 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 NAALADL2Q58DX5 795 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 MCTP2Q6DN12 878 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa28.41■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPK3Q9Y572 518 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM232C9JQI7 657 aa28.41■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD2Q14681 263 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 COBLL1Q53SF7 1204 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 HOMER1Q86YM7 354 aa28.41■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC51Q96ER9 411 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PANX2Q96RD6 677 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 USP27XA6NNY8 438 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 DNM1LO00429 736 aa28.4■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 CABP7Q86V35 215 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB34Q9BZG1 259 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP8BP34820 402 aa28.39■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 FEM1BQ9UK73 627 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR7Q9Y216 660 aa28.39■■■□□ 2.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM139Q8IV31 216 aa28.38■■■□□ 2.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM14Q14142 442 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ADSSL1Q8N142 457 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR9Q96QG7 549 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH4Q9Y623 1939 aa28.37■■■□□ 2.13
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