RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 APOA5Q6Q788 366 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ESR2Q92731 530 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DDX11Q96FC9 970 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SDF4Q9BRK5 362 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 IDI2Q9BXS1 227 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CBX8Q9HC52 389 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 INCENPQ9NQS7 918 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 LAMA4Q16363 1823 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 RELNP78509 3460 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D12O60347 775 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CUTAO60888 179 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DEXIO95424 95 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 AOC1P19801 751 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ADORA1P30542 326 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ZNF75DP51815 510 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TCTN1Q2MV58 587 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 EPC2Q52LR7 807 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 LBX2Q6XYB7 198 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DRC7Q8IY82 874 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FSIP1Q8NA03 581 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PGBD1Q96JS3 809 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 RAD9AQ99638 391 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.15□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 H3BNC9 293 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A4O14863 429 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 NCK2O43639 380 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 CYP2C9P11712 490 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 TDO2P48775 406 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ADAM15Q13444 863 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 IQCA1Q86XH1 822 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 USP28Q96RU2 1077 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ALG1Q9BT22 464 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.14□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 STRNO43815 780 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 DDAH1O94760 285 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 BAIAP3O94812 1187 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ERCC3P19447 782 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 TRAPPC10P48553 1259 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 PLCB2Q00722 1185 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 GPM6BQ13491 265 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 GPNMBQ14956 572 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 WTAPQ15007 396 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 VPS37DQ86XT2 251 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GGA3-218ENST00000584243 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms